MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 1

Total Repeats: 8561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014298	CGTT	2	8	41	48	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014298	AAAC	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014298	AG	3	6	144	149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014298	GTA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712407
5	NC_014298	CAG	2	6	298	303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
6	NC_014298	ACGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	300712407
7	NC_014298	GAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300712407
8	NC_014298	GGT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712407
9	NC_014298	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712407
10	NC_014298	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712407
11	NC_014298	ACC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712407
12	NC_014298	TTCC	2	8	478	485	0 %	50 %	0 %	50 %	300712407
13	NC_014298	TGGT	2	8	530	537	0 %	50 %	50 %	0 %	300712407
14	NC_014298	GAC	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
15	NC_014298	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712407
16	NC_014298	AGC	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
17	NC_014298	CTCG	2	8	652	659	0 %	25 %	25 %	50 %	300712407
18	NC_014298	CGC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712407
19	NC_014298	GA	3	6	716	721	50 %	0 %	50 %	0 %	300712407
20	NC_014298	GTC	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
21	NC_014298	TCA	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712407
22	NC_014298	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712407
23	NC_014298	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712407
24	NC_014298	CCA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712407
25	NC_014298	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
26	NC_014298	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	300712407
27	NC_014298	CATC	2	8	1068	1075	25 %	25 %	0 %	50 %	300712407
28	NC_014298	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
29	NC_014298	GTA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712407
30	NC_014298	TCC	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712407
31	NC_014298	CGT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
32	NC_014298	ACG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
33	NC_014298	GA	3	6	1458	1463	50 %	0 %	50 %	0 %	300712407
34	NC_014298	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
35	NC_014298	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
36	NC_014298	GCG	2	6	1520	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712407
37	NC_014298	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
38	NC_014298	TCG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
39	NC_014298	CG	3	6	1613	1618	0 %	0 %	50 %	50 %	300712407
40	NC_014298	CGTT	2	8	1676	1683	0 %	50 %	25 %	25 %	300712407
41	NC_014298	CG	3	6	1687	1692	0 %	0 %	50 %	50 %	300712407
42	NC_014298	GATT	2	8	1703	1710	25 %	50 %	25 %	0 %	300712407
43	NC_014298	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712407
44	NC_014298	GAG	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712407
45	NC_014298	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712407
46	NC_014298	GAT	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712407
47	NC_014298	GTC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712407
48	NC_014298	CGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712407
49	NC_014298	CCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712407
50	NC_014298	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014298	TGG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014298	GTC	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014298	ACG	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014298	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712408
55	NC_014298	GCC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712408
56	NC_014298	CGT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712408
57	NC_014298	CGG	2	6	2645	2650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712408
58	NC_014298	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712408
59	NC_014298	CGG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712408
60	NC_014298	CGAC	2	8	2698	2705	25 %	0 %	25 %	50 %	300712408
61	NC_014298	GGC	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712408
62	NC_014298	CCT	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712408
63	NC_014298	CG	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	300712408
64	NC_014298	ATC	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712408
65	NC_014298	TCGGCG	2	12	2770	2781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300712408
66	NC_014298	CAT	3	9	2787	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712408
67	NC_014298	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712408
68	NC_014298	GGTT	2	8	2845	2852	0 %	50 %	50 %	0 %	300712408
69	NC_014298	CGA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712408
70	NC_014298	ACC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300712408
71	NC_014298	CGT	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712408
72	NC_014298	CCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712408
73	NC_014298	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	300712408
74	NC_014298	GTC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712408
75	NC_014298	GGC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712408
76	NC_014298	TGG	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712408
77	NC_014298	GTC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014298	AAC	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014298	TCGC	2	8	3332	3339	0 %	25 %	25 %	50 %	300712409
80	NC_014298	CTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712409
81	NC_014298	ACG	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712409
82	NC_014298	CAG	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712409
83	NC_014298	TCA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712409
84	NC_014298	TCAC	2	8	3515	3522	25 %	25 %	0 %	50 %	300712409
85	NC_014298	GAGAG	2	10	3569	3578	40 %	0 %	60 %	0 %	300712409
86	NC_014298	ATA	2	6	3612	3617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300712409
87	NC_014298	CGTCG	2	10	3619	3628	0 %	20 %	40 %	40 %	300712409
88	NC_014298	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300712409
89	NC_014298	AGCG	2	8	3664	3671	25 %	0 %	50 %	25 %	300712409
90	NC_014298	TCA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712409
91	NC_014298	CGA	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712409
92	NC_014298	TC	3	6	3849	3854	0 %	50 %	0 %	50 %	300712409
93	NC_014298	CAG	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712409
94	NC_014298	GAT	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712409
95	NC_014298	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712409
96	NC_014298	CTG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712409
97	NC_014298	AGA	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014298	GTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014298	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712410
100	NC_014298	GTG	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712410
101	NC_014298	CGA	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712410
102	NC_014298	TG	3	6	4346	4351	0 %	50 %	50 %	0 %	300712410
103	NC_014298	TG	3	6	4358	4363	0 %	50 %	50 %	0 %	300712410
104	NC_014298	GAG	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712410
105	NC_014298	CACGAC	2	12	4444	4455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300712410
106	NC_014298	CTC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014298	ATCG	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014298	GT	3	6	4615	4620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014298	ACAGT	2	10	4635	4644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014298	GAC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014298	ATG	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014298	CTT	2	6	4771	4776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014298	GGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014298	GAGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014298	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014298	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300712411
117	NC_014298	TC	3	6	5090	5095	0 %	50 %	0 %	50 %	300712411
118	NC_014298	CCTG	2	8	5146	5153	0 %	25 %	25 %	50 %	300712411
119	NC_014298	TC	3	6	5180	5185	0 %	50 %	0 %	50 %	300712411
120	NC_014298	TCG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712411
121	NC_014298	TC	3	6	5240	5245	0 %	50 %	0 %	50 %	300712411
122	NC_014298	TC	3	6	5270	5275	0 %	50 %	0 %	50 %	300712411
123	NC_014298	GC	3	6	5319	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014298	GAC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712412
125	NC_014298	GAT	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712412
126	NC_014298	GAT	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712413
127	NC_014298	GTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712413
128	NC_014298	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	300712413
129	NC_014298	CAG	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712413
130	NC_014298	GCGA	2	8	5665	5672	25 %	0 %	50 %	25 %	300712413
131	NC_014298	GCG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712413
132	NC_014298	GTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712413
133	NC_014298	AGTGC	2	10	5827	5836	20 %	20 %	40 %	20 %	300712413
134	NC_014298	CGG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712413
135	NC_014298	GGC	2	6	5905	5910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712413
136	NC_014298	TGG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300712413
137	NC_014298	CGT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712413
138	NC_014298	ACG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712413
139	NC_014298	CATCG	2	10	6075	6084	20 %	20 %	20 %	40 %	300712413
140	NC_014298	CG	3	6	6102	6107	0 %	0 %	50 %	50 %	300712413
141	NC_014298	ATCG	2	8	6226	6233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014298	TCG	3	9	6231	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014298	CAC	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014298	TCG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014298	GTG	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014298	TCG	2	6	6620	6625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014298	CCT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014298	TGAT	2	8	6691	6698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014298	TGG	2	6	6715	6720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014298	AG	3	6	6773	6778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014298	GCGT	2	8	6807	6814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014298	AT	4	8	6821	6828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014298	GTC	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014298	GAT	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014298	GGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300712414
156	NC_014298	GCG	2	6	7024	7029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712414
157	NC_014298	CAGAC	2	10	7056	7065	40 %	0 %	20 %	40 %	300712414
158	NC_014298	GAC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712414
159	NC_014298	GAC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712414
160	NC_014298	AC	3	6	7246	7251	50 %	0 %	0 %	50 %	300712414
161	NC_014298	CCAG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014298	TCC	2	6	7406	7411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_014298	AG	3	6	7415	7420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014298	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014298	TCG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712415
166	NC_014298	CGT	2	6	7601	7606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712415
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168	NC_014298	GA	3	6	7674	7679	50 %	0 %	50 %	0 %	300712415
169	NC_014298	GAC	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712415
170	NC_014298	CCG	2	6	7752	7757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712415
171	NC_014298	CTG	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712415
172	NC_014298	GCA	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712415
173	NC_014298	TCC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712415
174	NC_014298	GCCT	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	300712415
175	NC_014298	CGG	2	6	7924	7929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712415
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178	NC_014298	GAC	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712415
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181	NC_014298	CGCT	2	8	8178	8185	0 %	25 %	25 %	50 %	300712415
182	NC_014298	CGG	2	6	8210	8215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300712416
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234	NC_014298	TGA	2	6	10571	10576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712417
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248	NC_014298	TCG	2	6	11420	11425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712417
249	NC_014298	TCCGG	2	10	11488	11497	0 %	20 %	40 %	40 %	300712417
250	NC_014298	CGT	2	6	11507	11512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712417
251	NC_014298	GCT	2	6	11582	11587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712417
252	NC_014298	CGGT	2	8	11606	11613	0 %	25 %	50 %	25 %	300712417
253	NC_014298	GCT	2	6	11626	11631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300712417
254	NC_014298	CGA	3	9	11694	11702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_014298	AGC	2	6	11752	11757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_014298	TCG	2	6	11760	11765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_014298	AGTC	2	8	11792	11799	25 %	25 %	25 %	25 %	300712418
258	NC_014298	CTC	2	6	11830	11835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712418
259	NC_014298	CGC	2	6	11847	11852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300712418
260	NC_014298	TCC	2	6	11873	11878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300712418
261	NC_014298	GACG	2	8	11916	11923	25 %	0 %	50 %	25 %	300712418
262	NC_014298	ACG	2	6	11957	11962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712418
263	NC_014298	CGA	2	6	11979	11984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300712418
264	NC_014298	CCCG	2	8	11995	12002	0 %	0 %	25 %	75 %	300712418
265	NC_014298	CCCA	2	8	12019	12026	25 %	0 %	0 %	75 %	300712418
266	NC_014298	CAT	2	6	12046	12051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300712418
267	NC_014298	GACC	2	8	12081	12088	25 %	0 %	25 %	50 %	300712418
268	NC_014298	AGT	2	6	12089	12094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300712418
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280	NC_014298	TAG	2	6	12545	12550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014298	TCT	2	6	12555	12560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_014298	TCCG	2	8	17674	17681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
390	NC_014298	AAT	2	6	17690	17695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_014298	TCT	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_014298	CT	3	6	17756	17761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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394	NC_014298	CAA	2	6	17778	17783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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